MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium abscessus plasmid

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010394	A	6	6	38	43	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010394	CG	3	6	73	78	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010394	CCT	2	6	126	131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_010394	CGG	2	6	1417	1422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010394	CGA	3	9	1753	1761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010394	CGAC	2	8	1774	1781	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010394	TCG	3	9	1824	1832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010394	GGC	2	6	1858	1863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010394	CGG	3	9	1864	1872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010394	ATC	2	6	1892	1897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010394	GCG	2	6	1968	1973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010394	CAT	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010394	CGA	2	6	1990	1995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010394	AC	3	6	2021	2026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010394	TTC	2	6	2037	2042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010394	CGG	2	6	2100	2105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010394	CGGC	2	8	2247	2254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010394	GCTTCT	2	12	2265	2276	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010394	GTC	2	6	2315	2320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010394	CTG	2	6	2337	2342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010394	TTC	2	6	2363	2368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010394	CGG	2	6	3873	3878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010394	CCG	2	6	3895	3900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010394	TGA	2	6	5365	5370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010394	C	7	7	5376	5382	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_010394	GCC	2	6	5415	5420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_010394	GCTG	2	8	5432	5439	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010394	CGC	3	9	5445	5453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_010394	TCG	2	6	7946	7951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010394	CCG	2	6	8722	8727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_010394	AC	4	8	9404	9411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010394	TGTGGC	3	18	9483	9500	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010394	TGTC	2	8	9505	9512	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010394	CCG	3	9	13263	13271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010394	ACC	3	9	16634	16642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010394	GC	3	6	16655	16660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010394	GC	3	6	16666	16671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010394	CA	3	6	16687	16692	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010394	GGT	2	6	16718	16723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010394	GGGT	2	8	16744	16751	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010394	GA	3	6	16810	16815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010394	GTGA	2	8	16838	16845	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010394	CGA	2	6	16850	16855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010394	GC	3	6	16904	16909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010394	CG	4	8	18024	18031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010394	CAC	2	6	18069	18074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_010394	AGC	2	6	18087	18092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010394	CAG	2	6	18101	18106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010394	GCG	2	6	18113	18118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010394	CG	3	6	18182	18187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010394	CCT	2	6	18454	18459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010394	GCC	2	6	18484	18489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010394	GCTG	2	8	18520	18527	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010394	CGG	2	6	18544	18549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010394	CCT	2	6	18692	18697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_010394	AGCC	2	8	19108	19115	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010394	CCGC	2	8	19165	19172	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_010394	CGG	2	6	19207	19212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010394	CGC	2	6	19231	19236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_010394	TCG	2	6	19321	19326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010394	GGC	2	6	19340	19345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010394	GCG	2	6	19346	19351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010394	CCG	2	6	19374	19379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_010394	TGCC	2	8	19394	19401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010394	CGG	3	9	19424	19432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010394	TCA	2	6	19444	19449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010394	GCAA	2	8	19769	19776	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010394	ACT	2	6	19788	19793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_010394	ATGC	3	12	19812	19823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010394	CGG	2	6	19849	19854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010394	GC	3	6	19875	19880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010394	CAG	2	6	19898	19903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010394	CAG	2	6	19940	19945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010394	GCG	2	6	19997	20002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010394	CCCG	2	8	20077	20084	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_010394	GGTG	2	8	20111	20118	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010394	GCG	2	6	20155	20160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010394	GAC	2	6	20173	20178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010394	CAC	2	6	20179	20184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_010394	CTCCC	2	10	20221	20230	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
81	NC_010394	GCG	2	6	20236	20241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010394	GTC	2	6	20255	20260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010394	TGA	2	6	20270	20275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010394	CGA	2	6	20303	20308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010394	ACG	2	6	20416	20421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010394	GGAT	2	8	20441	20448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010394	GGT	2	6	20474	20479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010394	GCTG	2	8	20498	20505	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010394	CT	3	6	20514	20519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010394	TCG	2	6	20569	20574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010394	CGT	2	6	20617	20622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010394	GTGGC	2	10	20623	20632	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_010394	CAA	2	6	20799	20804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010394	CG	3	6	20831	20836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010394	GGGC	2	8	20838	20845	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010394	CGT	2	6	20865	20870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010394	GA	3	6	20876	20881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010394	G	6	6	20911	20916	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010394	GC	4	8	20919	20926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_010394	TGCA	2	8	22148	22155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010394	ATGT	2	8	22191	22198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010394	GGT	2	6	22227	22232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010394	CT	3	6	23077	23082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010394	C	6	6	23122	23127	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_010394	TCA	2	6	23197	23202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.